荒漠与绿洲生态国家重点实验室于2011年4月批准建设，是新疆首个国家重点实验室。实验室面向国际干旱区研究前沿、国家经济社会发展重大需求和国民经济建设主战场，重点开展干旱区水资源利用与生态水文过程、绿洲生态过程与可持续管理、荒漠生态过程与荒漠化防治以及山地－绿洲－荒漠生态系统过程与区域综合模拟等方面研究，服务于国家丝绸之路经济带建设，为解决西北干旱区的资源可持续利用、生态可持续管理、区域可持续发展等重大科学与技术问题做出积极贡献。

2015年实验室共承担课题140项，其中，国家重大科学研究计划项目1项，课题3项，863计划课题1项，国家科技支撑计划课题4项，国际合作项目3项，国家自然科学基金项目51项，省部级项目15项，中国科学院项目28项，经费总额为20103.3万元。

2015年新增973前期研究专项1项，国家自然科学基金项目11项，其中，面上项目7项，青年基金项目1项，国家自然科学基金-新疆联合基金3项，各类项目经费总额1123万元。2015年获批国家自然科学基金项目40项，总经费930万元。

2015年度实验室出版专著7部，发表论文196篇，其中，SCI论文132篇；授权国家发明专利23项，登记软件著作权9项。“中国生态交错带生态价值评估与恢复治理关键技术”获2015年度国家科技进步二等奖。

2015年实验室固定人员81人，其中，引进新疆千人计划4名。2015年实验室吉力力·阿不都外力研究员当选哈萨克斯坦农业科学院外籍院士；李兰海研究员荣获2015年度自治区外国专家“天山奖”；李彦研究员荣获“自治区第十批有突出贡献优秀专家”荣誉称号；陈亚宁研究员获自治区民族团结进步模范个人荣誉称号；潘响亮研究员入选“万人计划”后备人选科技创新领军人才；田长彦研究员荣膺全国优秀科技工作者称号；赵成义研究员获2014年政府特殊津贴；李卫红、朱成刚撰写的《关于新疆农业高效节水运行机制问题的建议》被列为自治区重点提案。

2015年实验室在读硕士研究生121名，博士研究生110名，在站博士后31名。2015年硕士研究生毕业34名、博士研究生毕业29名，其中包括来自吉尔吉斯坦、哈萨克斯坦、印度等国的留学生。

2015年实验室学术交流879人次，其中，邀请国外同行来实验室学术交流104人次，国际会议交流76人次；实验室主办承办或协办学术会议8次。2015年5月16-26日开放期间，有500余人到实验室参观和考察学习。