荒漠与绿洲生态国家重点实验室于2011年4月批准建设，是新疆首个国家重点实验室。实验室面向国际干旱区研究前沿、国家经济社会发展重大需求和国民经济建设主战场，重点开展干旱区水资源利用与生态水文过程、绿洲生态过程与可持续管理、荒漠生态过程与荒漠化防治以及山地－绿洲－荒漠生态系统过程与区域综合模拟等方面研究，在解决国家新一轮西部大开发面临的资源可持续利用、生态可持续管理、区域可持续发展等重大科学与技术问题方面做出积极贡献。

2014年实验室共承担课题143项，其中，国家重大科学研究计划项目2项，课题3项，863计划课题1项，国家科技支撑计划课题4项，国际合作项目6项，国家自然科学基金项目46项，省部级项目14项，中国科学院项目28项，经费总额为23583万元。

2014年新增973项目1项，国家科技支撑计划课题2项，国家自然科学基金项目17项，其中，重点基金1项，国家自然科学基金-新疆联合基金本地优秀青年人才专项4项，面上项目10项，青年基金项目2项，各类项目经费总额3997万元。2014年获批基金11项，总经费1045万元。

2014年度实验室出版专著5部，发表论文186篇，其中，SCI论文120篇；授权国家发明专利13项，登记软件著作权7项；完成科技报告10份，提交咨询报告5份，科普报告7份；塔里木河水量调度管理会商决策系统被评选为“2014年度中国地理信息产业优秀工程—银奖”。

2014年实验室固定人员83人，其中，引进新疆千人计划6名。2014年实验室陈曦研究员、肖文交研究员入选科技创新领军人才；曾凡江研究员荣获“全国防沙治沙标兵”荣誉称号；李卫红研究员荣获“优秀政协委员”称号；黄湘、王玉刚入选“2014年自治区杰出青年科技人才”，李生宇、周洪华入选“2014年自治区优秀青年科技人才”。阜康荒漠草地生态系统国家野外科学观测研究站获得“自治区科技先锋号”荣誉称号。

2014年实验室在读硕士研究生110名，博士研究生99名，在站博士后28名。2014年硕士研究生毕业31名、博士研究生毕业21名，其中包括来自吉尔吉斯坦、哈萨克斯坦等国的留学生。

2014年实验室学术交流890人次，其中，邀请国外同行来实验室学术交流44人次，国际会议交流77人次；实验室主办承办或协办大型学术会议9次。2014年5月17-26日开放期间，有700余人到实验室参观和考察学习。