荒漠与绿洲生态国家重点实验室于2011年4月批准建设，是新疆首个国家重点实验室。实验室围绕国家西部大开发经济社会发展和生态建设需要，重点开展干旱区水资源利用与生态水文过程、绿洲生态过程与可持续管理、荒漠生态过程与荒漠化防治以及山地－绿洲－荒漠生态系统过程与区域综合模拟等方面研究，为解决国家新一轮西部大开发面临的资源可持续利用、生态可持续管理、区域可持续发展等重大科学与技术问题做出贡献。

2013年实验室共承担课题132项，其中，国家科技部973项目2项，国家科技支撑计划课题5项，科技部国际合作项目14项，国家自然科学基金项目38项，省部级项目16项，中国科学院项目36项，经费总额为25552.9万元。

2013年新增973课题1项，863课题1项，国家科技支撑计划课题2项，国家自然科学基金项目8项，其中，国家自然科学基金-新疆联合基金本地优秀青年人才专项1项，面上项目5项，青年基金项目2项，研究经费总额2842.4万元。

2013年度实验室出版专著2部，发表论文212篇，其中，SCI论文123篇，CSCD论文82篇。授权国家发明专利11项，登记软件著作权2项。

2013年实验室成果获新疆科技进步奖一等奖2项，二等奖1项。

2013年实验室固定人员72人，其中，引进新疆千人计划1名，刘铁，博士，比利时天主教鲁汶大学工作，主要从事干旱区流域水文模拟、气候变化和土地利用变化的水文响应研究。2013年实验室有4名年轻科技人员获得首批自治区青年科技创新人才项目资助，其中，李凯辉、吕昭智和杨玉海获得自治区优秀青年科技人才项目资助，付爱红获得自治区青年博士科技人才项目资助。2013年实验室在读硕士研究生112名，博士研究生97名，在站博士后24名。2013年硕士研究生毕业40名、博士研究生毕业15名。

2013年实验室学术交流780人次，其中，邀请国外同行来实验室学术交流48人次，国际会议交流67人次；实验室主办承办或协办大型学术会议4次。2013年5月18-24日开放期间，有700余人到实验室参观和考察学习。

2013年实验室顺利通过建设期验收，成为新疆第一个国家重点实验室。