荒漠与绿洲生态国家重点实验室以中国科学院为主管单位，以中国科学院新疆生态与地理研究所为依托单位。2011年4月批准立项，成为新疆维吾尔自治区获准立项的首个国家重点实验室。实验室围绕国家西部大开发经济社会发展和生态建设需要，重点开展干旱区水资源利用与生态水文过程、绿洲生态过程与可持续管理、荒漠生态过程与荒漠化防治以及山地—绿洲—荒漠生态系统过程与区域综合模拟等方面研究，为解决国家新一轮西部大开发特别是新疆实现跨越式发展面临的资源可持续利用、生态可持续管理以及区域可持续发展中的重大科学与技术问题作出贡献。
2011年实验室共承担课题108项，其中，国家科技部973项目2项，国家科技支撑计划课题3项，科技部国际合作项目12项，国家自然科学基金项目26项，省部级项目8项，中国科学院项目44项，经费总额为12380.9万元。2011年新申请国家自然科学基金项目16项，其中，重点项目1项，国家自然科学基金-新疆联合基金本地优秀青年人才专项1项，面上项目11项，青年科学基金项目3项，研究经费总额1300万元。
2011年度实验室研究人员发表论文219篇，其中，SCI论文74篇（包括12篇online），EI论文28篇。申请国家发明专利13项，获得专利授权7项，登记软件著作权22项。
2011年度科研成果获国家和自治区科技奖3项，其中，干旱荒漠区土地生产力培植与生态安全保障技术成果获2011年度国家科技进步二等奖。
2011年实验室学术交流420人次，其中请国外同行来实验室讲学40人次，实验室成员到国外参加会议38 人次；实验室主办（承办或协办）大型学术会议4次。
2011年新引进百人计划3名、杰出青年基金获得者1名。实验室在读硕士研究生104名，博士研究生70名，在站博士后16名，访问学者及进修人员4人。2011年硕士研究生毕业25名、博士研究生毕业10名。
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